ADN

Entrez les bases (A, T, C, G)

5ATCGCTAG

5'-ATCGGCTAG-3'

ARN

Entrez les bases entre parenthèses avec le préfixe "r" r(A, U, T, G)

5r(UUUACCGA)

ARN, UUUACCGA

Mixte ADN-ARN

Entrez les bases d'ADN normalement et les bases d'ARN entre parenthèses avec le préfixe « r »

5ACTGCGT(rU)C(rG)

ADN+ARN, ACTTGCGTUCG

LNA

Entrez les bases entre parenthèses avec le préfixe "+"

5ACT(+G)(+G)(+T)CG

ADN+LNA, ACTGGTCG

BP

Entrez les bases entre parenthèses avec le préfixe "m"

5(mC)GTGCA(mC)(mC)

ADN+PMO, CGTGCACC

Bases dégénérées

Utilisez la nomenclature UIPAC (voir bases oscillantes)

5ACTTGCNN

ADN avec deux bases dégénérées (3'), ACTTGCNN

Modifications internes (voir onglet Modifications)

Saisir la base modifiée suivie du code de modification entre parenthèses

5r(UUCGU[Biotine]CU)

ARN avec U biotinylé interne, UUCGUCU

Modifications du terminal (voir onglet modifications)

Utilisé le menu dropdopwn pour les modifications 5' et 3'

/5Phos/AAATGCC/3Biotine/

ADN avec 5' Phosphate et 3' Biotine, Phos-AAATGCC-Biotine

Modifications fournies par l'utilisateur (voir l'onglet nt fourni par l'utilisateur)

Entrez les bases fournies par l'utilisateur comme (#1), (#2), (#3), etc... (chacune étant définie dans l'onglet approprié)

5CCTG(#1)C(#2)G

ADN contenant deux bases fournies par l'utilisateur, CCTG (fourni par l'utilisateur 1) C (fourni par l'utilisateur 2) G

Phosphonothioates

Entre "*" pour désigner les liaisons phosphonothioate

5CT*G*GC*G

ADN avec 3 liaisons phosphonothioates, CT-G-GC-G